很久以前，三个族群的小马相亲相爱地生活在一起。直到有一天，居住在马儿湾的陆马、缰绳森林的独角兽、微风高地的飞马都失去了魔法。独角兽不会发光，飞马也无法飞翔……与此同时，他们都各自封闭了自己的族群，不再和其他小马来往。陆马认为独角兽的角会发射激光伤害他人，而飞马则认为陆马不仅懒惰且脑容量很小。这些讹传令不同族群的小马对其他同类充满不信任。

事情的转机发生在相信魔法的陆马桑尼身上。和其他只想着如何防御外种族小马的陆马不同的是，桑尼从小就盼望着能见到独角兽和飞马，并和他们做朋友。终于有一天，一头美丽的独角兽伊兹来到了马儿湾。这让桑尼惊喜万分，却让其他陆马受到了巨大的惊吓——他们担心独角兽的角发出激光。他们启动了事先预备好的机关来捕捉伊兹，却被桑尼一一化解。桑尼带着伊兹逃出马儿湾，两匹小马决定前往微风高地，和飞马一起找回三个族群失去已久的魔法。可是她们在微风高地发现，几乎所有的飞马都不能飞翔了，除了皇室成员。

更讽刺的是，皇室成员是依靠吊威亚和控制舞台制造出能够飞翔的假象。实际上，所有的飞马都已经失去了飞翔的魔法……皇室成员为了安抚失去希望的飞马国民、维护统治地位的稳定，用飞翔表演代替了告知民众真相。

作为一匹相信魔法、希望世界变得更好、有些理想主义的小马，桑尼在故事中起到了关键性的核心作用。她一腔热血地希望用理想化的方式来解决种群之间积累已久的问题，在群族之间不断说和、沟通，试图让大家相互理解，站在对方的角度考虑问题等等，这让她看起来也许有点幼稚。实际上，最终问题的大爆发，还是不可避免地导向了一场激烈的战斗。无论是飞马、独角兽还是陆马，错综复杂的关系都令大家无法继续平和地谈判。在一场混战之中，来自三个族群的水晶被桑尼和朋友们拼接在了一起。令人遗憾的是，历经千辛万苦之后，小马族群的魔法并没有恢复，一切还是老样子。

忽然，桑尼意识到问题并不是出现在水晶这里。她需要拼合的并不是水晶，而是三个部落之间的隔阂与矛盾。当然了，这是一个令人意料之中的、稍显普通的结尾：主人公发现魔法实际上需要所有人一起努力才能恢复，而这正是解决重要问题的钥匙。

影片中出现了令人印象颇深的一些情节：例如飞马皇室的公主热衷于直播，却在直播中不小心暴露了陆马桑尼和独角兽伊兹已经进入飞马国的实情，这令飞马国的公民们大跌眼镜。此外，影片中的三个族群都有自己不同的特点：陆马的马儿湾是一个热衷于高科技的现代部落，因此他们成立了公司，生产出各式各样用于对付其他小马族群的科技产品；独角兽是一群隐居森林的森系小动物，他们所在的缰绳森林生活节奏缓慢，魔法的远去令他们再也无法打起精神来；而飞马所在的微风高地则是一个现代国度，他们不仅开直播，还观看演唱会和大型表演……

最终的解决是圆满的，桑尼帮助小马族群找回了魔法，她自己也成为集合三个族群特征的结合体。爱与和平是解决问题的钥匙，而小马族群们也将携手迈进一个充满希望的新世代。